Departemen Biokimia merupakan salah satu Departemen termuda di Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam IPB yang berlokasi di Bogor Jawa Barat Indonesia tepatnya di Kampus IPB Dramaga, Jl. Tanjung, Gedung Biokimia. Departemen Biokimia diselenggarakan berdasarkan Surat Keputusan Rektor IPB No.180/K13.12.1/PP/2001, dengan mandat “Mengembangkan Ilmu Dasar, Konsep dan Metode dalam Bidang Biokimia”.
Departemen Biokimia saat ini menyelenggarakan program pendidikan akademik yaitu program Sarjana Biokimia dan Magister Biokimia. Penyelenggaraan Program Sarjana Departemen Biokimia diselenggarakan atas ijin dari Direktorat Jendral Perguruan Tinggi dengan Surat Keputusan DIKTI Nomor : – Tanggal 21-09-2007. Sampai saat ini Program Sarjana Departemen Biokimia telah melakukan proses akreditasi, yaitu pada tahun 2023 yang berlaku sampai dengan tahun 2028, dengan kualifikasi predikat UNGGUL, berdasarkan keputusan LAMSAMA Nomor: 089/SK/LAMSAMA/Akred/S/IX/2023. Berdasarkan data Evaluasi Dikti (2012), Program Sarjana Departemen Biokimia merupakan satu-satunya Program Sarjana bidang biokimia yang diselenggarakan di Indonesia. Sementara itu untuk program Pascasarjana, Departemen Biokimia menyelenggarakan Program Magister Biokimia dengan akreditasi A.